Pesantren Al-Qur’an Assa’idiyyah didirikan oleh Gus H. Ali Musthofa Asady, S. Psi, cucu dari pendiri pondok pesantren Nurul Ulum Kebonsari – Malang yakni Mbah Kyai H. Muhammad Syifa’ dengan Mbah Nyai Hj. Rohmah Nur. Beliau di dampingi oleh Ning Hj. Khulasotul Aini, cucu dari Mbah H. Sa’id Salim yang mewariskan lahan yang didirikan Pesantren Al-Qur’an Assa’idiyyah yang bertempat di Jl. Lingkar Barat (Jalibar) Kepanjen, Kab. Malang.